其中，有三個系統為核心子系統：
一、醫院集中供水系統
醫院集中供水系統主要包括醫用純水集中供應系統和酸性氧化電位水集中供應系統，基本涵蓋了一個綜合性醫院的所有醫療用水種類。
二、 醫院中水利用系統
醫院中水利用系統主要包括雨水收集與處理系統和中水處理系統，可以有效提高醫院的綜合水資源利用率，節省大量資源。

三、醫院污水深度處理系統
醫療污水處理系統，主要采用兩種處理工藝，傳統處理工藝和MBR深度處理工藝，處理范圍涵蓋了醫療機構門診、病房、手術室、各類檢驗室、病理解剖室、放射室、洗衣房、太平間等處排出的診療、生活及糞便污水及與上述污水混合排出時的醫療機構其他污水。

醫院集中供水系統設計需遵循五大設計原則：
1、先進性：采用國際或國內通行的先進技術。
2、成熟性：以適用為原則，采用成熟的或經過工程檢驗的先進技術。
3、標準化：采用標準化的設計和標準化的產品。
4、安全性：包括系統自身安全和信息傳遞的安全。
5、設計使用壽命：提供全新的和質量一流的的材料及設備，并設計成長期使用壽命期，適用于每天連續工作24小時。
在此五大原則的基礎上，通過以膜分離為技術核心的處理工藝“預處理系統->反滲透系統->后處理系統->循環輸配系統”，實現“集中制水，分質供水”，達到如下要求：
1、能耗低，運行費用低。
2、設備選型合理、可靠、先進、高效節能，最大可能地減少投資費用、維修費用。
3、運行安全，系統考慮應急處理措施，異常情況下保證一定時間的供水及重點科室供水。
4、充分考慮濃水綜合利用，提高水資源利用率。
5、提供的材料及設備是全新的和質量一流的，并設計成長期使用壽命期，適用于每天連續工作24小時。
6、系統設備易于檢驗、清洗、潤滑及維修。
醫療污水處理系統設計需遵循六大設計原則：
1、全過程控制原則：對醫院污水產生、處理、排放的全過程進行控制。

2、減量化原則：嚴格醫院內部衛生管理體系，在污水和污物發生源處進行嚴格控制和分離，醫院內生活污水與病區污水分別收集，即源頭控制，清污分流。

3、就地處理原則：為防止醫院污水輸送過程中的污染與危害，在醫院必須就地處理。

4、分類指導原則：根據醫院污水性質、規模、排放去向和地區差異，對醫院污水處理進行分類指導。

5、達標與風險控制相結合原則：全面考慮綜合性醫院和傳染病醫院達標排放的基本要求，同時加強風險控制意識，從工藝技術、工程建設和監督管理等方面提升應對突發性時間的處理能力。

6、生態安全原則：有效去除污水中有毒有害物質，減少消毒過程中消毒副產物產生和控制出水中過高余氯，保護生態環境安全。

7、在此六大基礎原則的基礎上，通過傳統處理工藝和MBR深度處理工藝，是醫療污水能達到《醫療機構水污染物排放標準》GB 18466-2005的排放標準。